自费药保险公司不赔偿的依据主要来源于保险合同的条款。在大多数保险合同中，包括交强险、商业三者险、商业车上人员座位险等，都有明确条款规定保险公司不承担自费药部分的赔偿责任。以下是一些具体原因：

保险合同条款：保险公司在保险合同中明确规定，对于医保自费项目，保险公司不承担赔偿责任。这类项目通常包括自费药物、诊疗项目、医疗服务等。

保险理赔范围：保险公司在销售保险时，会根据不同险种的规定，明确保险理赔范围。自费药通常不在保险理赔范围内，因此保险公司不承担赔偿责任。

法律规定：根据《机动车交通事故责任强制保险条例》等相关法律法规，保险公司对交通事故中的医疗费用赔偿有一定的责任，但并未明确规定保险公司需要赔偿自费药部分。

行业惯例：在保险行业中，自费药不赔偿已经成为一种普遍现象。保险公司会根据保监会的相关规定和行业惯例，制定相应的保险条款，以确保保险合同的公平性和合理性。

综上所述，自费药保险公司不赔偿的依据主要是保险合同条款、保险理赔范围、法律规定以及行业惯例。在发生交通事故时，保险公司按照合同约定和法律规定，对医疗费用进行赔偿，而自费药部分则不在赔偿范围之内。