参加的险种不同：技工证交社保通常只参加养老保险和医疗保险，而不参加工伤保险、生育保险，部分地区可以参加失业保险。灵活就业交社保则参加养老、医疗、工伤、生育和失业等五种保险。

缴费基数和比例不同：技工证交社保的缴费基数以上年全省在岗职工月平均工资的40%-100%为缴费基数，养老保险缴费比例为20%，医疗保险缴费以当地上年度城镇在岗职工月平均工资的80%为基数，按4.2%或8%比例缴纳基本医疗保险费。灵活就业交社保的缴费基数以本人上年度月平均工资为缴费基数，社保缴费由单位缴纳一定比例，个人缴纳一定比例。

缴费主体不同：技工证交社保个人承担全额费用。灵活就业交社保缴纳社保所需费用由用人单位和职工共同承担，用人单位承担大部分，职工承担小部分。

户籍限制不同：技工证交社保个人缴纳社保必须拥有当地户籍，没有当地户籍只能参加城镇职工社保。灵活就业交社保缴纳职工社保没有户籍限制，只要是全日制上班都可以缴纳。

缴费意愿不同：技工证交社保可以根据自己的实际情况来决定是否要缴纳社保费用。灵活就业交社保必须按照规定缴纳社保。

法定退休年龄可能不同：技工证交社保的法定退休年龄各地不统一。灵活就业交社保的女参保人法定退休年龄各地不统一，有的地区全体都是50岁，有的地区全体都是55岁，有的地区部分定向群体是50岁，部分群体是55岁。

生育待遇不同：技工证交社保不能交生育保险，灵活就业交社保不能交生育保险，但是极少数省市可以交失业保险。灵活就业人员如果丈夫交了生育保险，丈夫可以申请一次性生育补助。

退休待遇成本不同：如果在职人员和灵活就业人员选择的相同缴费基数、缴费年限和退休年龄相同，理论上退休待遇完全一样，但是两者付出的成本完全不同。