1.参保对象不同.农村合作医疗保险的参保对象是农村户口的农村居民，且通常情况下为资源缴纳。社保参保对象为在职职工或城镇居民，如果为在职职工，则是社会强制保险，必须缴纳。
2享受待遇不同.农村合作医疗：是在农村必须是农村户口才能参加新农合，当年缴费，次年需再交钱才可以享受新农合。
3.保障力度不同.新农合：基金由于是多方筹资的关系，所以在保障力度上还稍稍欠缺了点。社保：实行“低水平、广覆盖”的特点，因此一经参保，标准都是统一享受的。
新农合和百万医疗险各有优势，选择哪个更好取决于个人的需求和实际情况。
新农合是一种农村居民医疗保险，由政府出资和农民自愿缴纳保费组成。它的优势在于覆盖范围广、保费低、政府补贴多，可以为农民提供基本的医疗保障。
百万医疗险是一种商业保险，通过缴纳保费来获取医疗保障。它的优势在于保额高、报销快、选择性强，可以为个人提供更全面的医疗保障，包括住院、手术、门诊等各个方面。
因此，如果个人是农村居民且经济条件允许，建议优先选择新农合作为基本的医疗保障。如果个人是城市居民或经济条件较好，可以选择百万医疗险来获取更全面的医疗保障。
需要注意的是，无论是新农合还是百万医疗险，都有一定的报销比例和免赔额，因此不能完全依赖保险来应对所有医疗费用。在选择医疗保险时，个人应根据自身的需求和经济状况进行合理选择。